Юная Джин Грей обращается в пристанище для таких же заблудших детей, как она. Бедняжка боится внутренней силы, живущей в ее теле. Поначалу девочка думает, что ее преследует мрачное знамение, а все близкие обречены на мучительные страдания, но постепенно знакомится с миром мутантов, живущих в подобных условиях. Наставник пытается оградить ребенка от ее собственной мощи, но однажды пророчество «Люди Икс: Тёмный Феникс» сбывается наяву. Обладатели сверхъестественных способностей видят в бывшей подруге воплощение зла. Девушка поздно узнает о своем даре, раскрывает его истинную природу, потому чувствует себя преданной учителями и партнерами.

Ярость, таящаяся в сердце, выливается в жуткие поступки, способные разрушить хрупкий баланс между мирами. Определенные организации усиленно ищут повод для изоляции супергероев от гражданского общества, и бывшая поборница добра, а ныне неудержимая фурия дает злопыхателям повод для пересудов. Героическому сообществу приходится выбирать между дружбой и спасением человечества. Мудрые мутанты обязаны хранить верность личным идеалам о чести и мужестве, но преследовать вчерашнюю подругу и соратницу сложнее, чем кажется издалека. Удастся ли героям совладать с чувствами и выполнить свою печальную миссию?