Победа над зачинщиком войны с землянами не позволила мутантам долго наслаждаться триумфом. Население по-прежнему настороженно наблюдало за сообщениями прессы, искало повод для устроения гонений для сверхсильных соседей. Последователи заточенного злодея продолжили старательно исследовать темницу, чтобы вызволить лидера. Тем временем вторжение сумасбродного одиночки в президентские палаты вызвало бурю народного гнева. Земляне решили, что «Люди Икс 2» не имеют права бесконтрольно расхаживать по планете. Создавшейся общественной паникой успевает умело воспользоваться заядлый противник сближения с необычными силачами Уильям Страйкер.

Захват школы Профессора Икс является прямым объявлением войны существам с особыми возможностями. Логану, Роуг и нескольким другим заложникам ситуации удается чудом выбраться из ловушки. Беглецы подвергаются большому риску, передвигаясь по городским улочкам. Хитрый преследователь намерен совершить немыслимые маневры, чтобы расправиться с неординарной кастой. Между гонимыми героями расползается слух о причастности врага к давней лабораторной группе, задействованной в создание сверхчеловека. Коалиция с Магнето становится для отшельников единственным шансом избавиться от коварного чудовища.