Коварный вирус видоизменяет планету. Человечество подвергается воздействию смертоносной пандемии. Медикам и ученым не удается остановить губительный вирус. Отсутствие спасительных вакцин приводит к стремительному опустошению государств. Злодейский заговор «12 обезьян 4 сезон» направлен против землян усилиями гениального профессора. Коул находится в тюрьме в разгар эпидемии. Арестант давно распрощался с мечтами о свободе. Расплатой за многочисленные прегрешения стал пожизненный срок без права на амнистию. Назревший апокалипсис помогает узнику получить определенную свободу.

Гость подземной лаборатории проявляет стойкость к инфекции. Его соратники со схожим иммунитетом ищут пути возрождения наций. Талантливая изобретательница обнаруживает единственную лазейку, способную помочь ее единомышленникам. Женщина предлагает смельчаку пробраться в прошлое ради предотвращения катастрофы. Бывший заключенный со слабыми моральными устоями внезапно становится последней надеждой цивилизации. Путешественник во времени обязуется выследить и ликвидировать коварного экспериментатора, который изобрел опасный штамм. Миссионеру придется вступать в неожиданные коалиции и утаивать свои намерения, чтобы выполнить поручение.