Длительное плавание утомляет группу моряков, вынужденных больше полугода бороздить океан с исследовательской целью. Среди пассажиров судна числится ученый, имеющий другое задание, не связанное с общей миссией экипажа. Когда странствующий «Последний корабль 5 сезон» возвращается домой, оружейные залпы обрушиваются на растерянных людей. Вместо приветствия гости сталкиваются с враждебным настроем незнакомых властителей. Мир перевернулся под воздействием особой формы гриппа. Массовое вымирание населения разрушило былой паритет сил на планете. Глобальная эпидемия дезориентировала власти и развалила прежние режимы.

Доктор, пребывающая на борту, имеет достаточно материала для борьбы с мутациями вируса. Женщине требуется надежная охрана ради окончания работы над вакциной. Но коварный враг выступает против создания спасительной сыворотки и жаждет любой ценой уничтожить плавучую лабораторию. Морпехи превращаются в последнюю надежду человечества и стараются предотвратить дальнейший разгул инфекции. Усилиями бравых членов экипажа удается справиться с разрушительными последствиями голода. Когда профессору удается приручить вирус, назревает следующая серьезная угроза. Колумбийцы наступают на север, а враждующие государства готовятся к продолжительной осаде ради сохранения и завоевания территорий.